ولد سماحة العلّامة المرجع السيّد محمد حسين فضل الله (رض) في العام 1354هـ/ الموافق 1935 ميلاديّة، في مدينة النّجف الأشرف، في أسرة علميّة معروفة بالعلم والأدب، يعود نسبها إلى الإمام الحسن (ع).والده: آية الله السيِّد عبد الرؤوف فضل الله (قده)، الّذي كان من أكابر علماء جبل عامل، والّذي كان للمرجع فضل الله علاقة خاصّة به، وتأثّر به إلى حدّ بعيد.والدته: الحاجة رؤوفة كريمة الحاج حسن بزّي، الّذي يُعدّ من الوجوه الخيِّرة المؤمنة في بلدة بنت جبيل -جنوب لبنان.عمّه: آية الله السيّد محمد سعيد فضل الله، والّذي كان يعدّ من العلماء الكبار في ذلك الوقت، وقد تأثّر المرجع فضل الله كثيراً به.